Старший инженер по биоинформатике в UKEESS Software House

UKEESS Software House ищетSenior Bioinformatics Engineerна полную работу день (или в офисе во Львове, или с возможностью удаленного сотрудничества в Украине).

О заказчике:

О проекте и команде:< /span>

Вы присоединитесь к команде Data Science Engineering, работающей над проектами, связаны с исследованием ДНК.  Один из наших проектов — прогнозирование черт людей с помощью SNP.

Технический стек проекта:  Python 3.8-3.11 / Django / MySQL / Nextflow / Airflow / PySpark / Docker / AWS (IAM, S3, EC2, FSx for Lustre) / Kubernetes 

Обязанности нашего будущего коллеги:

• Проектирование и имплементация Nextflow-пайплайнов для обработки SNPs

• Работа по data engineering/processing/analytic

• Работа с облачной средой (сервисы AWS)

• Определение возможности внедрения инновационных технологий

• Написание кода и юнит-тестов

• Постоянный код-ревью пул-реквестов

• Диагностика сложных проблем с привлечением нескольких систем и технологий

Наш идеальный кандидат - это инженер по:

• хорошими навыками владения Python

• способностью вычислять итоговую статистику для выборок данных

• критическим мышлением и открыт к новым знаниям и навыкам.

Необходимый опыт и навыки:

• Хорошие знания или опыт работы с инструментами для Биоинформатики и базами данных: DBs: BLAST, GATK, NCBI, UCSC Genome browser и т.д.

• 5+ лет коммерческого опыта работы с Python

• Коммерческий опыт работы с реляционными базами данных (MySQL желательно)

• Коммерческий опыт работы с инструментами оркестрации (Airflow / Nextflow желательно)

• Опыт с AWS (S3, EC2)

• Опыт работы с CI/CD

• Английский: выше среднего по меньшей мере (разговорная и письменная)

Будет преимуществом:

• Хорошие знания или опыт с PySpark

• Хорошие знания или опыт с Django или Flask

• Хорошие знания или опыт с Rust

• Хорошие знания или опыт по Java

• Опыт с Docker и Kubernetes

• Знания или опыт с Scikit-learn

• Опыт с AWS FSx for Lustre и SageMaker 

• Знания или опыт с ML

• Коммерческий опыт работы с Airflow и/или Kubernetes

Что мы предлагаем новому коллеге?

• Конкурентоспособная компенсация (на основе рыночных данных, но также зависит от технического уровня кандидата)

• Гибкий график работы

• Ежегодный оплачиваемый отпуск

• Бесплатные уроки английского (онлайн)

• Медицинское страхование или две альтернативы по выбору

• Индивидуальные планы для профессионального и личностного развития

• Заграничные командировки (после войны)

• Парковка на территории и зарядная станция для электромобилей

• Корпоративные подарки, праздники и развлечения

• Спортивные активности: настольный теннис, футбол, воркаут

Отправьте нам свое резюме и давайте познакомимся! ;)

----------------------------------------------- -------------------------------------------------- -------------------

Team of UKEESS Software House является текущим видом наSenior Bioinformatics Engineer Об Customer:

Этот customer является world's largest DNA network from the USA. With more than 30 billion digitized global historical records, 130 million family trees, and 18+ million people in their rosing database, our family stories and gain действенные идеи об их здоровье и благополучии. 

О проекте и команде:

Вы присоединитесь к команде разработчиков данных и будете работать над исследовательскими проектами ДНК. Один из наших проектов — прогнозирование черт характера людей с помощью SNP.

Как часть команды, вы будет  работать над инфраструктурой и исследовательской деятельностью, такой как настройка EMR, управление/управление озером данных , деятельность в облачной среде, автоматизация рабочих процессов, обработка данных и аналитика. 

Стек технологий:< span style="font-weight: 400; font-style: нормальный; text-decoration: none"> Python 3.8–3.11/Django/MySQL/Nextflow/Airflow/PySpark/Docker/AWS (IAM, S3, EC2, FSx для Lustre) / Kubernetes 

В обязанности будет входить:

• Помогайте проектировать, проектировать и разрабатывать сложные крупномасштабные системы, обрабатывающие миллиарды записей каждый день

• Разработка конвейера ETL с использованием Искра и воздушный поток

• Разработать и внедрить конвейер Nextflow для обработки SNP

• Работа с обработкой/инжинирингом/аналитикой данных

• Работа с облачной средой (сервисы AWS)

• Определить возможности внедрения инновационных технологий и автоматизации рабочего процесса

• Написание кода и модульных тестов

• Проводить проверки кода

• Диагностика сложных проблем, связанных с несколькими системами и технологиями

• Будьте примером инженерного мастерства

Наш идеальный кандидат будет обладать хорошими навыками Python, правильным сочетанием критического мышления, работоспособностью, глубокими основами программирования, пониманием данных временных рядов и способностью рассчитывать сводную статистику для выборок данных. .

Требования:

• Знания или опыт работы с инструментами биоинформатики и базами данных: BLAST, GATK, NCBI, браузер генома UCSC и т. д.

• 5+ лет коммерческого опыта работы с Python 

• Коммерческий опыт работы с реляционными базами данных (предпочтителен MySQL) 

• Коммерческий опыт работы с инструментами оркестрации (предпочтителен Airflow/Nextflow)

• Опыт работы с AWS (S3, EC2)

• Опыт работы с CI/CD

• Английский язык: как минимум выше среднего (разговорный и письменный)

Будет плюсом:

• Хорошие знания или коммерческий опыт работы с PySpark

• Хорошие знания или коммерческий опыт работы с Django или Flask

• Хорошие знания или коммерческий опыт работы с Rust 

• Опыт работы с Docker и Kubernetes

• Знания или коммерческий опыт работы с Scikit-learn

• Опыт работы с AWS FSx для Lustre и SageMaker 

• Хорошие знания или коммерческий опыт работы с Java

• Знания или опыт работы с машинным обучением

Что мы предлагаем нашему новому коллеге?

• Конкурентное вознаграждение (на основе рыночных данных, а также в зависимости от технического уровня кандидата)

• Гибкий график работы

• 3 пакета медицинского обслуживания на выбор

• Ежегодный оплачиваемый отпуск и празднование государственных праздников

• Бесплатные уроки английского языка (онлайн)

• Индивидуальный подход к профессиональному росту

• Отсутствие бюрократии и микроменеджмента

• Современные, комфортабельные офисные помещения (зона барбекю, кухни, комната отдыхакомнаты, кофемашины и т. д.)

• Зарубежные командировки

• Стоянка и зарядная станция для электромобилей на территории< /span>

• Корпоративные подарки, праздники и развлекательные мероприятия

• Спорт: настольный теннис, футбол, тренировки< /p>

Если у вас есть страсть к решению сложных задач; создание масштабируемых и надежных систем; любите работать с новейшими технологиями в быстро развивающейся и гибкой среде; и воодушевлены перспективой оказать существенное влияние на продукты, у которых более 3 миллионов платных подписчиков, тогда мы хотим поговорить с вами! ;-)