Leitender Bioinformatik-Ingenieur in UKEESS Software House

UKEESS Software House suchtSenior BioinformaticsTag (entweder im Büro in Lemberg , oder mit der Möglichkeit einer Fernzusammenarbeit in der Ukraine).

Über den Kunden:

Über das Projekt und das Team:

Sie werden Teil des Data Science Engineering-Teams und arbeiten an Projekten im Zusammenhang mit DNA Forschung.  Eines unserer Projekte ist die Vorhersage menschlicher Eigenschaften mithilfe von SNPs.

In diesem Beitrag Sie wird mit Infrastruktur- und Forschungsaktivitäten wie EMR-Einrichtung, Data Lake-Management, Cloud Computing, Workflow-Automatisierung, Data Mining und Analyse arbeiten. 

Technischer Stack des Projekts: Python 3.8-3.11 / Django / MySQL / Nextflow / Airflow / PySpark / Docker / AWS (IAM, S3, EC2 , FSx für Lustre) / Kubernetes

Aufgaben unseres zukünftigen Kollegen :

• Entwerfen und Entwickeln komplexer Großsysteme, die täglich Milliarden historischer Aufzeichnungen verarbeiten

• Design und Implementierung von Nextflow-Pipelines zur Verarbeitung von SNPs

• Arbeiten mit Datentechnik/-verarbeitung/-analytik

• Arbeiten mit der Cloud-Umgebung (AWS-Dienste)

• Ermittlung der Möglichkeit der Implementierung innovativer Technologien

• Code und Unit-Tests schreiben

• Permanente Codeüberprüfung von Poolanfragen

• Diagnose komplexer Probleme mit mehreren Systemen und Technologien

Unser idealer Kandidat ist ein Ingenieur mit:

• gute Python-Kenntnisse

• Möglichkeit, zusammenfassende Statistiken für Datenproben zu berechnen

• kritisches Denken und offen für neues Wissen und neue Fähigkeiten.

Erforderliche Erfahrung und Fähigkeiten:

• Gute Kenntnisse oder Erfahrung mit Bioinformatik-Tools und Datenbanken: DBs: BLAST, GATK, NCBI, UCSC Genombrowser usw.

• 5+ Jahre kommerzielle Python-Erfahrung

• Kommerzielle Erfahrung mit relationalen Datenbanken (MySQL bevorzugt)

• Kommerzielle Erfahrung mit Orchestrierungstools (Airflow / Nextflow bevorzugt)

• Erfahrung mit AWS (S3, EC2)

• CI/CD-Erfahrung

• Englisch: mindestens überdurchschnittlich (in Wort und Schrift)

Wäre von Vorteil:

• Gute Kenntnisse oder Erfahrung mit PySpark

• Gute Kenntnisse oder Erfahrung mit Django oder Flask

• Gute Kenntnisse oder Erfahrung mit Rust

• Gute Kenntnisse oder Erfahrung mit Java

• Erfahrung mit Docker und Kubernetes

• Kenntnisse oder Erfahrung mit Scikit-learn

• Erfahrung mit AWS FSx für Lustre und SageMaker 

• Kenntnisse oder Erfahrung mit ML

• Kommerzielle Erfahrung mit Airflow und/oder Kubernetes

Was bieten wir einem neuen Kollegen?

• Wettbewerbsfähige Vergütung (basierend auf Marktdaten, aber auch abhängig vom technischen Niveau des Kandidaten)

• Flexibler Arbeitsplan

• Bezahlter Jahresurlaub

• Kostenlose Englischstunden

• Krankenversicherung oder zwei Alternativen zur Auswahl

• Fehlen von Bürokratie und Mikromanagement"> normal; Textdekoration: keine">

  Modern komfortables Büro (Grillplatz, Küche usw.)

• Auslandsdienstreisen (nach dem Krieg)

• Parken auf dem Gelände und eine Ladestation für Elektroautos

• Firmengeschenke, Feiertage und Unterhaltung

• Sportliche Aktivitäten: Tischtennis, Fußball, Training

Schicken Sie uns Ihren Lebenslauf und wir lernen uns kennen! ;)

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Das Team von UKEESS Software House sucht derzeit nach einem Senior Bioinformatics Engineer um unserem Team für eine Vollzeitstelle beizutreten (remote in der Ukraine oder im Büro in Lemberg).

Über den Kunden:

Unser Kunde ist das weltweit größte DNA-Netzwerk aus den USA. Mit mehr als 30 Milliarden digitalisierten globalen historischen Aufzeichnungen, 130 Millionen Stammbäumen und mehr als 18 Millionen Menschen in ihrer wachsenden Datenbank helfen unsere Kunden Menschen, ihre DNA zu entdecken Familiengeschichten und Gain umsetzbare Erkenntnisse über ihre Gesundheit und ihr Wohlbefinden. 

Über das Projekt und das Team:

Sie werden dem Data Science Engineering-Team beitreten und an DNA-Forschungsprojekten arbeiten. Eines unserer Projekte ist die Vorhersage menschlicher Eigenschaften mithilfe von SNPs.

Als Teil des Teams will  Arbeit an Infrastruktur und Forschungsaktivitäten, wie z. B. Einrichtung von EMR, Data Lake Management/Governance , Cloud-Umgebungsaktivitäten, Workflow-Automatisierung, Datentechnik und Analysen. 

Technologie-Stack:< span style="font-weight: 400; font-style: normal; text-decoration: none"> Python 3.8-3.11 / Django / MySQL / Nextflow / Airflow / PySpark / Docker / AWS (IAM, S3, EC2, FSx für Lustre) / Kubernetes 

Zu den Aufgaben gehören:

• Helfen Sie bei der Architektur, Gestaltung und Entwicklung komplexer, großer Systeme, die täglich Milliarden von Datensätzen verarbeiten

• Entwicklung einer ETL-Pipeline Spark und Airflow

• Entwerfen und implementieren Sie eine Nextflow-Pipeline zur Verarbeitung von SNPs

• Arbeiten mit Datenverarbeitung/-technik/-analytik

• Arbeiten mit Cloud-Umgebung (AWS-Dienste)

• Möglichkeiten zur Einführung innovativer Technologien und Automatisierungsworkflows identifizieren

• Code und Unit-Tests schreiben

• Codeüberprüfungen durchführen

• Diagnose komplexer Probleme mit mehreren Systemen und Technologien

• Seien Sie ein Beispiel für technische Exzellenz

Unser idealer Kandidat verfügt über gute Python-Kenntnisse, die richtige Mischung aus kritischem Denken, eine Macher-Einstellung, solide Programmiergrundlagen, ein Verständnis für Zeitreihendaten und die Fähigkeit, zusammenfassende Statistiken für Datenproben zu berechnen .

Anforderungen:

• Kenntnisse oder Erfahrung mit Bioinformatik-Tools und DBs: BLAST, GATK, NCBI, UCSC-Genombrowser usw.

• 5+ Jahre kommerzielle Erfahrung mit Python 

• Kommerzielle Erfahrung mit relationalen Datenbanken (MySQL ist vorzuziehen) 

• Kommerzielle Erfahrung mit Orchestrierungstools (Airflow / Nextflow ist vorzuziehen)

• Erfahrung mit AWS (S3, EC2)

• Erfahrung mit CI/CD

• Englisch: mindestens obere Mittelstufe (sowohl gesprochen als auch geschrieben)

Es wird ein Plus sein:

• Gute Kenntnisse oder kommerzielle Erfahrung mit PySpark

• Ausgeprägte Kenntnisse oder kommerzielle Erfahrung mit Django oder Flask

• Gute Kenntnisse oder kommerzielle Erfahrung mit Rust 

• Erfahrung mit Docker und Kubernetes

• Kenntnisse oder kommerzielle Erfahrung mit Scikit-learn

• Erfahrung mit AWS FSx für Lustre und SageMaker 

• Gute Kenntnisse oder kommerzielle Erfahrung mit Java

• Kenntnisse oder Erfahrung mit ML

Was bieten wir unserem neuen Kollegen?

• Wettbewerbsfähige Vergütung (basierend auf Marktdaten, aber auch abhängig vom technischen Niveau des Kandidaten)

• Flexibler Arbeitsplan

• 3 Gesundheitspakete zur Auswahl

• Jährlicher bezahlter Urlaub und staatliche Feiertagsfeier

• Kostenlose Englischkurse (online)

• Individueller Ansatz zur beruflichen Weiterentwicklung

• Mangel an Bürokratie und Mikromanagement

• Moderne, komfortable Büroeinrichtungen (Grillzone, Küchen, Lounge).e Räume, Kaffeemaschinen usw.)

• Auslandsdienstreisen

• Parkplatz und Ladestation für Elektroautos< /span>

• Firmengeschenke, Feiern und lustige Aktivitäten

• Sportliche Aktivitäten: Tischtennis, Fußball, Training< /p>

Wenn Sie eine Leidenschaft für die Lösung anspruchsvoller Probleme haben; Aufbau skalierbarer, robuster Systeme; lieben es, mit den neuesten Technologien in einem schnelllebigen, flexiblen Umfeld zu arbeiten; und freuen uns über die Aussicht, einen erheblichen Einfluss auf Produkte zu haben, die mehr als 3 Millionen zahlende Abonnenten haben, dann möchten wir mit Ihnen sprechen! ;-)