Starszy inżynier bioinformatyki w UKEESS Software House

UKEESS Software House poszukujeStarszy Bioinformatyka dzień (albo w biurze we Lwowie lub z możliwością współpracy zdalnej na Ukrainie).

O kliencie:

O projekcie i zespole: < /span>

Dołączysz do zespołu Data Science Engineering pracującego nad projektami związanymi z DNA badania.  Jednym z naszych projektów jest przewidywanie cech ludzkich za pomocą SNP.

W tym poście będzie współpracować z infrastrukturą i działaniami badawczymi, takimi jak konfiguracja EMR, zarządzanie Data Lake, przetwarzanie w chmurze, automatyzacja przepływu pracy, eksploracja i analityka danych. 

Techniczny stos projektu: Python 3.8-3.11 / Django / MySQL / Nextflow / Airflow / PySpark / Docker / AWS (IAM, S3, EC2 , FSx dla Lustre) / Kubernetes

Zadania naszego przyszłego kolegi :

• Projektowanie i rozwijanie złożonych, wielkoskalowych systemów, które codziennie przetwarzają miliardy rekordów historycznych

• Rozwój rurociągów ETL przy użyciu Spark Airflow

• Projekt i wdrożenie potoków Nextflow do przetwarzania SNP

• Praca z inżynierią/przetwarzaniem/analityką danych

• Praca w środowisku chmurowym (usługi AWS)

• Określenie możliwości wdrożenia innowacyjnych technologii

• Pisanie kodu i testów jednostkowych

• Stały przegląd kodu żądań puli

• Diagnostyka złożonych problemów obejmujących kilka systemów i technologii

Nasz idealny kandydat to inżynier z:

• dobra znajomość języka Python

• możliwość obliczania statystyk podsumowujących dla próbek danych

• krytyczne myślenie i otwartość na nową wiedzę i umiejętności.

Wymagane doświadczenie i umiejętności:

• Dobra znajomość lub doświadczenie z narzędziami bioinformatycznymi i bazami danych: DB: BLAST, GATK, NCBI, UCSC Przeglądarka genomu itp.

• Ponad 5 lat komercyjnego doświadczenia w Pythonie

• Doświadczenie komercyjne z relacyjnymi bazami danych (preferowany MySQL)

• Doświadczenie komercyjne z narzędziami do orkiestracji (preferowany Airflow / Nextflow)

• Doświadczenie z AWS (S3, EC2)

• Doświadczenie CI/CD

• Angielski: co najmniej powyżej średniej (w mowie i piśmie)

Byłaby zaletą:

• Dobra znajomość lub doświadczenie z PySpark

• Dobra znajomość lub doświadczenie z Django lub Flask

• Dobra znajomość lub doświadczenie z Rustem

• Dobra znajomość lub doświadczenie z Javą

• Doświadczenie z Dockerem i Kubernetesem

• Wiedza lub doświadczenie z Scikit-learn

• Doświadczenie z AWS FSx dla Lustre i SageMaker 

• Wiedza lub doświadczenie w zakresie ML

• Doświadczenia komercyjne z Airflow i/lub Kubernetes

Co oferujemy nowemu współpracownikowi?

• Konkurencyjne wynagrodzenie (oparte na danych rynkowych, ale także zależne od poziomu technicznego kandydata)

• Elastyczny grafik pracy

• Coroczny płatny urlop

• Darmowe lekcje języka angielskiego

• Ubezpieczenie zdrowotne lub dwie alternatywy do wyboru

• Indywidualne plany rozwoju zawodowego i osobistego

• Brak biurokracji i mikrozarządzania"> normalna; dekoracja tekstu: brak">

  Nowoczesne wygodne biuro (miejsce na grilla, kuchnia itp. )

• Zagraniczne wyjazdy służbowe (po wojnie)

• Parking na terenie oraz stacja ładowania samochodów elektrycznych

• Prezenty firmowe, święta i rozrywka

• Zajęcia sportowe: tenis stołowy, piłka nożna, trening

Wyślij nam swoje CV i poznajmy się! ;)

-------------------------------------------------------- ---------- ---------------------------------------------- -------- -------------------

Zespół UKEESS Software House poszukuje obecnie starszy inżynier bioinformatyki aby dołączyć do naszego zespołu na pełen etat (zdalnie na Ukrainie lub w biurze we Lwowie).

O kliencie:

Naszym klientem jest największa na świecie sieć DNA z USA. Dzięki ponad 30 miliardom zdigitalizowanych globalnych rekordów historycznych, 130 milionom drzew genealogicznych i ponad 18 milionom osób w rosnącej bazie danych, nasi klienci pomagają ludziom odkrywać ich historie rodzinne i gain praktyczne spostrzeżenia na temat ich zdrowia i dobrego samopoczucia. 

O projekcie i zespole:

Dołączysz do zespołu Data Science Engineering i będziesz pracować nad projektami badawczymi DNA. Jednym z naszych projektów jest przewidywanie cech ludzi za pomocą SNP.

Jako część zespołu możesz będzie infrastrukturą i działaniami badawczymi, takimi jak konfigurowanie EMR, zarządzanie/zarządzanie Data Lake , działania w środowisku chmury, automatyzacja przepływu pracy, inżynieria danych i analityka. 

Stos technologii:< span style="font-weight: 400; styl czcionki: normalny; dekoracja tekstu: brak"> Python 3.8-3.11 / Django / MySQL / Nextflow / Airflow / PySpark / Docker / AWS (IAM, S3, EC2, FSx dla Lustre) / Kubernetes 

Do obowiązków należeć będzie:

• Pomóż w projektowaniu, projektowaniu i opracowywaniu złożonych systemów na dużą skalę, które codziennie przetwarzają miliardy rekordów

• Rozwój przy użyciu potoku ETL Iskra i przepływ powietrza

• Zaprojektuj i zaimplementuj potok Nextflow do przetwarzania SNP

• Praca z przetwarzaniem danych/inżynierią/analityką

• Praca w środowisku chmurowym (usługi AWS)

• Identyfikacja możliwości zastosowania innowacyjnych technologii i automatyzacji przepływu pracy

• Napisz kod i testy jednostkowe

• Przeprowadź przegląd kodu

• Diagnozuj złożone problemy dotyczące wielu systemów i technologii

• Bądź przykładem doskonałości inżynieryjnej

Nasz idealny kandydat będzie posiadać dobrą znajomość języka Python, odpowiednią mieszankę krytycznego myślenia, postawę „można zrobić”, solidne podstawy programowania, zrozumienie danych szeregów czasowych i umiejętność obliczania statystyk podsumowujących dla próbek danych .

Wymagania:

• Wiedza lub doświadczenie z narzędziami bioinformatycznymi i bazami danych: BLAST, GATK, NCBI, UCSC Przeglądarka genomu itp.

• ponad 5 lat komercyjnego doświadczenia z Pythonem

• Komercyjne doświadczenie z relacyjnymi bazami danych (preferowany MySQL) 

• Doświadczenie komercyjne z narzędziami do orkiestracji (preferowany Airflow / Nextflow)

• Doświadczenie z AWS (S3, EC2)

• Doświadczenie z CI/CD

• Angielski: Przynajmniej średnio zaawansowany (w mowie i piśmie)

Będzie plusem:

• Dobra znajomość lub doświadczenie komercyjne w zakresie PySpark

• Dobra znajomość lub doświadczenie komercyjne z Django lub Flask

• Dobra znajomość lub doświadczenie komercyjne w zakresie Rust

• Doświadczenie z Dockerem i Kubernetesem

• Wiedza lub doświadczenie komercyjne w zakresie Scikit-learn

• Doświadczenie z AWS FSx dla Lustre i SageMaker 

• Dobra znajomość lub komercyjne doświadczenie w zakresie języka Java

• Wiedza lub doświadczenie w zakresie ML

Co oferujemy naszemu nowemu koledze?

• Konkurencyjne wynagrodzenie (w oparciu o dane rynkowe, ale także zależne od poziomu technicznego kandydata)

• Elastyczny grafik pracy

• 3 pakiety zdrowotne do wyboru

• Coroczny płatny urlop i obchody święta państwowego

• Darmowe zajęcia z języka angielskiego (online)

• Indywidualne podejście do rozwoju zawodowego

• Brak biurokracji i mikrozarządzania

• Nowoczesne, komfortowe zaplecze biurowe (strefa grillowa, kuchnie, salonpokoje, ekspresy do kawy itp.)

• Zagraniczne podróże służbowe

• Na miejscu parking i stacja ładowania samochodów elektrycznych< /span>

• Prezenty firmowe, uroczystości i zabawy

• Zajęcia sportowe: ping-pong, piłka nożna, trening< /p>

Jeśli pasjonujesz się rozwiązywaniem trudnych problemów; budowanie skalowalnych, solidnych systemów; uwielbiasz pracować z najnowszymi technologiami w dynamicznym, elastycznym środowisku; i jesteś podekscytowany perspektywą wywarcia znaczącego wpływu na produkty, które mają ponad 3 miliony płacących subskrybentów, to chcemy z Tobą porozmawiać! ;-)